记者近日从中国科学院西北高原生物研究所获悉,该研究所研究员张同作联合青海大学副教授魏青等团队,成功组装藏羚染色体级别的基因组,获得藏羚染色体水平的高质量基因组和注释信息。相关研究结果发表在国际学术期刊《自然》旗下综合性科学期刊《科学数据》上。
藏羚是国家一级保护动物,主要分布在青海可可西里、西藏羌塘、新疆阿尔金山等自然保护区,在维持青藏高原生态系统平衡中具有重要作用,是研究高海拔适应性机制和迁徙行为的良好模型。但目前公开数据库中仍缺少藏羚高质量的染色体水平基因组,严重限制了基于遗传特征解析其物种适应、进化及种群生态相关工作的开展。
这是藏羚基因组的组装和注释结果。(受访单位供图)
通过多种测序技术,研究团队成功组装了藏羚染色体级别的基因组。张同作表示,数据评估表明组装的连续性好,完整度和准确性高;藏羚基因组中重复序列注释结果表明,藏羚基因组重复序列总长度为1.65GB,占基因组的52.47%,同时在藏羚基因组上共注释到28330个功能基因。
张同作介绍,此次成功组装藏羚染色体级别的基因组,将为藏羚的适应进化遗传机制、保护遗传学研究及进一步探索物种迁徙行为的遗传机制提供重要基因组资源。(记者陈杰)
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